環氧乙烷滅菌箱由于環氧乙烷易燃、易爆，且對人有毒，所以必須在密閉的環氧乙烷滅菌器內進行。目前使用的環氧乙烷滅菌箱種類很多，大型的容器有數十立方米，中等的有1～10立方米，小型的有零點幾至1立方米。它們各有不同的用途。
大型環氧乙烷滅菌器：
一般用于大量處理物品的滅菌，用藥量為0.8kg/m³～1.2kg/m³，在55℃～60℃下作用6h。
特點：
①環氧乙烷可用于不耐高溫、不耐濕物品的滅菌。
②環氧乙烷被認為是一種滅菌效果很好的化學滅菌劑，可殺滅所有微生物包含細菌芽胞。
③穿透性強，可用以各種難通透部位的滅菌：如有些較細、較長的導管用其他低溫滅菌方法很難達到滅菌效果，而只能用環氧乙烷或輻照。
④對物品損壞小，因為環氧乙烷殺滅微生物是利用烷基化原理而非氧化過程，因此對物品損壞非常小，對不耐熱精密儀器滅菌有著非常廣泛的用處。
⑤滅菌時，能夠用各種包裹材料包裹，便于貯存、運送，翻開包裹即可運用避免了交叉污染的危險。
⑥有規范的化學、生物監測手段，從而能夠有效地控制滅菌質量，及時發現滅菌失利的包裹。
⑦有幾十年的運用經歷。
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